国贸a市区有一所私立中学，这所学校是全国屈指可数天才、优秀学生所在之地。有那么一个传闻，这所学校里有一个名为“ace”的特殊班级，据说是全校最顶尖学生的所呆之地，被称为——王牌教室。然而自从有一天在一位神秘转校生到来后，那个神秘班级的十二位特殊生也逐渐浮出水面。吊儿郎当的班主任，有暴力倾向的班长，学渣学习委员，没有运动神经的体育委员等等让人大跌眼镜的角色……不过没有人知道原来这个被学校和国家一起向外撒谎的特殊教室，那传闻的十二人竟然是世界最强的特殊部队成员，是被各国挑选出来的魔法特等生。一个个危险居高的任务，各种不平常的遭遇，这个教室里学生和班主任的特殊校园生活就此展开。